El tercer episodio de la serie y el primero con una perspectiva 3D.
Duke Nukem 3D es un videojuego 3D de acción en primera persona, creado y distribuido por 3D Realms en 1996. Es la continuación de dos juegos de plataforma anteriores, Duke Nukem y Duke Nukem II. La extensión del juego recibe el nombre de Duke Nukem 3D Atomic Edicition.
Contrario a los shooters que le preceden, en Duke Nukem 3D se puede apreciar una gran variedad de niveles, que incluyen espacios abiertos y ambientación desde calles a ciudades sumergidas o estaciones espaciales.
El juego incluye una amplia variedad de armas, desde la clásica pistola o escopeta, a armas experimentales capaces de congelar o encoger a los enemigos, pasando por lanzamisiles o bombas por control remoto.